Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NCOA1Q15788 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
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NCOA1Q15788 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NCOA1Q15788 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
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