Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP13Q15645 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms