Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRADDQ15628 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRADDQ15628 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRADDQ15628 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRADDQ15628 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRADDQ15628 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRADDQ15628 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRADDQ15628 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRADDQ15628 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRADDQ15628 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRADDQ15628 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRADDQ15628 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRADDQ15628 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRADDQ15628 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRADDQ15628 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRADDQ15628 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRADDQ15628 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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