Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PUM3Q15397 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PUM3Q15397 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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