Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RABEP1Q15276 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABEP1Q15276 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
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