Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms