Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRD3Q15059 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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