Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMD6Q15008 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD6Q15008 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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