Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CHD4Q14839 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
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CHD4Q14839 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
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CHD4Q14839 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
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CHD4Q14839 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
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CHD4Q14839 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
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CHD4Q14839 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
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CHD4Q14839 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
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CHD4Q14839 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
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CHD4Q14839 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
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CHD4Q14839 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
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