Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRCAPQ14761 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms