Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RFTN1Q14699 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
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RFTN1Q14699 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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