Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMC1AQ14683 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms