Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDC1Q14676 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MDC1Q14676 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDC1Q14676 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDC1Q14676 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDC1Q14676 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDC1Q14676 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDC1Q14676 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MDC1Q14676 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MDC1Q14676 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MDC1Q14676 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MDC1Q14676 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MDC1Q14676 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MDC1Q14676 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MDC1Q14676 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MDC1Q14676 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MDC1Q14676 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MDC1Q14676 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MDC1Q14676 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MDC1Q14676 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MDC1Q14676 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MDC1Q14676 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MDC1Q14676 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MDC1Q14676 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MDC1Q14676 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MDC1Q14676 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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