Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IHHQ14623 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IHHQ14623 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IHHQ14623 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IHHQ14623 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IHHQ14623 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IHHQ14623 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IHHQ14623 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IHHQ14623 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IHHQ14623 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IHHQ14623 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IHHQ14623 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IHHQ14623 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IHHQ14623 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IHHQ14623 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IHHQ14623 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IHHQ14623 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IHHQ14623 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IHHQ14623 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
IHHQ14623 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
IHHQ14623 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IHHQ14623 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IHHQ14623 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IHHQ14623 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IHHQ14623 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IHHQ14623 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
IHHQ14623 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IHHQ14623 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IHHQ14623 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IHHQ14623 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IHHQ14623 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IHHQ14623 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IHHQ14623 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
IHHQ14623 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IHHQ14623 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IHHQ14623 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IHHQ14623 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
IHHQ14623 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
IHHQ14623 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IHHQ14623 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IHHQ14623 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IHHQ14623 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IHHQ14623 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IHHQ14623 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IHHQ14623 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IHHQ14623 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IHHQ14623 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IHHQ14623 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IHHQ14623 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IHHQ14623 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IHHQ14623 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IHHQ14623 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IHHQ14623 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IHHQ14623 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IHHQ14623 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IHHQ14623 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IHHQ14623 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IHHQ14623 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IHHQ14623 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IHHQ14623 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IHHQ14623 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IHHQ14623 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
IHHQ14623 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IHHQ14623 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IHHQ14623 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IHHQ14623 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
IHHQ14623 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
IHHQ14623 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IHHQ14623 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IHHQ14623 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IHHQ14623 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IHHQ14623 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IHHQ14623 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
IHHQ14623 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IHHQ14623 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IHHQ14623 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IHHQ14623 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IHHQ14623 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IHHQ14623 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IHHQ14623 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IHHQ14623 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
IHHQ14623 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IHHQ14623 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IHHQ14623 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IHHQ14623 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
IHHQ14623 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IHHQ14623 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IHHQ14623 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IHHQ14623 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IHHQ14623 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IHHQ14623 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IHHQ14623 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IHHQ14623 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IHHQ14623 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IHHQ14623 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IHHQ14623 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IHHQ14623 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IHHQ14623 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IHHQ14623 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IHHQ14623 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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