Protein–RNA interactions for Protein: Q14409

GK3P, Glycerol kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GK3PQ14409 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GK3PQ14409 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GK3PQ14409 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms