Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IKBKEQ14164 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IKBKEQ14164 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
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