Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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COL4A6Q14031 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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COL4A6Q14031 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A6Q14031 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A6Q14031 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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