Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPSQ13938 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPSQ13938 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
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