Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ALCAMQ13740 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALCAMQ13740 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
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