Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP1A4Q13733 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP1A4Q13733 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms