Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PMS2P11Q13670 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P11Q13670 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms