Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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PEX6Q13608 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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PEX6Q13608 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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PEX6Q13608 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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PEX6Q13608 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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PEX6Q13608 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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PEX6Q13608 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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PEX6Q13608 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX6Q13608 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
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