Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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TMED1Q13445 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
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TMED1Q13445 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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TMED1Q13445 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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TMED1Q13445 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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TMED1Q13445 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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TMED1Q13445 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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TMED1Q13445 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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TMED1Q13445 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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TMED1Q13445 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMED1Q13445 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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