Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
UBE2V1Q13404 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
UBE2V1Q13404 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms