Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3FQ13275 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3FQ13275 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
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