Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PAPPAQ13219 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PAPPAQ13219 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PAPPAQ13219 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PAPPAQ13219 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PAPPAQ13219 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PAPPAQ13219 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PAPPAQ13219 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAPPAQ13219 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAPPAQ13219 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAPPAQ13219 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAPPAQ13219 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAPPAQ13219 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAPPAQ13219 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAPPAQ13219 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAPPAQ13219 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAPPAQ13219 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAPPAQ13219 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAPPAQ13219 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAPPAQ13219 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAPPAQ13219 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAPPAQ13219 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PAPPAQ13219 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAPPAQ13219 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAPPAQ13219 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAPPAQ13219 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAPPAQ13219 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAPPAQ13219 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAPPAQ13219 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAPPAQ13219 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAPPAQ13219 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAPPAQ13219 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAPPAQ13219 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAPPAQ13219 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms