Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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IFT88Q13099 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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IFT88Q13099 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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IFT88Q13099 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IFT88Q13099 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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IFT88Q13099 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
IFT88Q13099 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
IFT88Q13099 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
IFT88Q13099 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFT88Q13099 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFT88Q13099 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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IFT88Q13099 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFT88Q13099 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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IFT88Q13099 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFT88Q13099 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFT88Q13099 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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IFT88Q13099 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFT88Q13099 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFT88Q13099 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFT88Q13099 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFT88Q13099 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFT88Q13099 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFT88Q13099 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IFT88Q13099 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFT88Q13099 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFT88Q13099 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFT88Q13099 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFT88Q13099 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFT88Q13099 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFT88Q13099 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFT88Q13099 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
IFT88Q13099 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFT88Q13099 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFT88Q13099 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFT88Q13099 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFT88Q13099 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IFT88Q13099 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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