Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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