Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CNTN1Q12860 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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