Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNH2Q12809 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNH2Q12809 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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