Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TFCP2Q12800 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFCP2Q12800 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms