Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SREBF2Q12772 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SREBF2Q12772 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SREBF2Q12772 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
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