Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 RPS28BYLR264W 204 nt2.91□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 YPR014CYPR014C 330 nt2.91□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 IOC3YFR013W 2364 nt2.91□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 VHR2YER064C 1518 nt2.91□□□□□ -1.94
LCB4Q12246 TCP1YDR212W 1680 nt2.9□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 IRC4YDR540C 540 nt2.9□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 RRF1YHR038W 693 nt2.9□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 RPL37AYLR185W 267 nt2.9□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 BSC3YLR465C 309 nt2.9□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 SIP18YMR175W 240 nt2.9□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 DGK1YOR311C 873 nt2.9□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.9□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.9□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.9□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.9□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.9□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 YCL019WYCL019W 5313 nt2.9□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.89□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 VOA1YGR106C 798 nt2.89□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 YJR023CYJR023C 402 nt2.89□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 RPL6AYML073C 531 nt2.89□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 DNA2YHR164C 4569 nt2.89□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 GCD6YDR211W 2139 nt2.89□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 SMC2YFR031C 3513 nt2.88□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt2.88□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 RPL20BYOR312C 519 nt2.88□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.87□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 APC11YDL008W 498 nt2.87□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 SDH7YDR511W 402 nt2.87□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 AST2YER101C 1293 nt2.87□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 LAG1YHL003C 1236 nt2.87□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 YML037CYML037C 1023 nt2.87□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 ZEO1YOL109W 342 nt2.87□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 ISU1YPL135W 498 nt2.87□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 snR191snR191 274 nt2.87□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 DPB11YJL090C 2295 nt2.87□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 SNQ2YDR011W 4506 nt2.87□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 DIA2YOR080W 2199 nt2.87□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 PMR1YGL167C 2853 nt2.86□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 VPS64YDR200C 1815 nt2.86□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 ROY1YMR258C 1662 nt2.86□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 SPO71YDR104C 3738 nt2.86□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 ERG28YER044C 447 nt2.86□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.86□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 RPS21BYJL136C 264 nt2.86□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 UNG1YML021C 1080 nt2.86□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 PEX17YNL214W 600 nt2.86□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 YPL185WYPL185W 396 nt2.86□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 NSL1YPL233W 651 nt2.86□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 MET5YJR137C 4329 nt2.86□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 NIC96YFR002W 2520 nt2.86□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 MAK21YDR060W 3078 nt2.86□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 SIP3YNL257C 3690 nt2.86□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 IKI3YLR384C 4050 nt2.85□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 YKL100CYKL100C 1764 nt2.85□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 TSA2YDR453C 591 nt2.85□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 YGR025WYGR025W 303 nt2.85□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 RPS20YHL015W 366 nt2.85□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.85□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.85□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 YKL111CYKL111C 336 nt2.85□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.85□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.85□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.85□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.85□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 YAR068WYAR068W 486 nt2.85□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 YNL146WYNL146W 303 nt2.85□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 RPB11YOL005C 363 nt2.85□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 ERP4YOR016C 624 nt2.85□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 snR13snR13 124 nt2.85□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 RPL33AYPL143W 324 nt2.85□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 PDC2YDR081C 2778 nt2.85□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 CCT7YJL111W 1653 nt2.85□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 UBP14YBR058C 2346 nt2.85□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 CDH1YGL003C 1701 nt2.85□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 NPR1YNL183C 2373 nt2.85□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.84□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 YLR434CYLR434C 384 nt2.84□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 SSN8YNL025C 972 nt2.84□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 PEP12YOR036W 867 nt2.84□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt2.84□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 YOR385WYOR385W 873 nt2.84□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 SLM6YBR266C 453 nt2.84□□□□□ -1.95
LCB4Q12246 TSC11YER093C 4293 nt2.84□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 SEN54YPL083C 1404 nt2.84□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 NDT80YHR124W 1884 nt2.84□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 MDM32YOR147W 1869 nt2.84□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 RAX2YLR084C 3663 nt2.83□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 NOP19YGR251W 591 nt2.83□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 GPI14YJR013W 1212 nt2.83□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 SWM2YNR004W 441 nt2.83□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 CAF120YNL278W 3183 nt2.83□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 RRM3YHR031C 2172 nt2.83□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 BUD4YJR092W 4344 nt2.82□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 SPO14YKR031C 5052 nt2.82□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 RPC10YHR143W-A 213 nt2.82□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 RPS24BYIL069C 408 nt2.82□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YMR141CYMR141C 309 nt2.82□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 URA10YMR271C 684 nt2.82□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YNL043CYNL043C 321 nt2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.7 ms