Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIPPLY1Q0D2K3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms