Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms