Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBQ06643 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBQ06643 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LTBQ06643 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LTBQ06643 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LTBQ06643 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LTBQ06643 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LTBQ06643 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LTBQ06643 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LTBQ06643 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LTBQ06643 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LTBQ06643 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LTBQ06643 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LTBQ06643 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LTBQ06643 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LTBQ06643 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LTBQ06643 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LTBQ06643 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LTBQ06643 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LTBQ06643 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LTBQ06643 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LTBQ06643 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LTBQ06643 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LTBQ06643 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LTBQ06643 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LTBQ06643 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LTBQ06643 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LTBQ06643 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LTBQ06643 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LTBQ06643 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
LTBQ06643 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LTBQ06643 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LTBQ06643 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LTBQ06643 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LTBQ06643 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LTBQ06643 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LTBQ06643 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LTBQ06643 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LTBQ06643 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LTBQ06643 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LTBQ06643 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LTBQ06643 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LTBQ06643 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LTBQ06643 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LTBQ06643 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LTBQ06643 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LTBQ06643 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LTBQ06643 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LTBQ06643 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LTBQ06643 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LTBQ06643 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LTBQ06643 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LTBQ06643 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LTBQ06643 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LTBQ06643 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LTBQ06643 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LTBQ06643 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LTBQ06643 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LTBQ06643 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LTBQ06643 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LTBQ06643 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LTBQ06643 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
LTBQ06643 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LTBQ06643 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LTBQ06643 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LTBQ06643 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LTBQ06643 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LTBQ06643 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBQ06643 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBQ06643 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBQ06643 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBQ06643 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBQ06643 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBQ06643 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBQ06643 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBQ06643 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBQ06643 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBQ06643 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBQ06643 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBQ06643 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBQ06643 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBQ06643 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBQ06643 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBQ06643 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBQ06643 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBQ06643 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBQ06643 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBQ06643 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBQ06643 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBQ06643 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBQ06643 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBQ06643 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBQ06643 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LTBQ06643 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBQ06643 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBQ06643 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBQ06643 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBQ06643 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBQ06643 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LTBQ06643 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms