Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSME1Q06323 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSME1Q06323 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms