Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 ACB1YGR037C 264 nt1.65□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 PRP38YGR075C 729 nt1.65□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 EST3YIL009C-A 546 nt1.65□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 COX8YLR395C 237 nt1.65□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 URA5YML106W 681 nt1.65□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt1.65□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 YBL108WYBL108W 306 nt1.65□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 REV3YPL167C 4515 nt1.65□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 CBF2YGR140W 2871 nt1.65□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 NTF2YER009W 378 nt1.64□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 YER068C-AYER068C-A 432 nt1.64□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 PEA2YER149C 1263 nt1.64□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 STE2YFL026W 1296 nt1.64□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 YGL230CYGL230C 444 nt1.64□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 YAL064WYAL064W 285 nt1.64□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 RPS16AYMR143W 432 nt1.64□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 PAI3YMR174C 207 nt1.64□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 MIX23YBL107C 591 nt1.64□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 YOR392WYOR392W 444 nt1.64□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 RGA2YDR379W 3030 nt1.64□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 MES1YGR264C 2256 nt1.64□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 YEL043WYEL043W 2871 nt1.64□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 STD1YOR047C 1335 nt1.64□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.63□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 YER158W-AYER158W-A 216 nt1.63□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 YNR021WYNR021W 1215 nt1.63□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 TRM7YBR061C 933 nt1.63□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 RXT2YBR095C 1293 nt1.63□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 SHS1YDL225W 1656 nt1.63□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 BUD2YKL092C 3315 nt1.63□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 REV1YOR346W 2958 nt1.62□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 IRC4YDR540C 540 nt1.62□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 RSM27YGR215W 333 nt1.62□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 FSH1YHR049W 732 nt1.62□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 RPA34YJL148W 702 nt1.62□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt1.62□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt1.62□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.62□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 DCP1YOL149W 696 nt1.62□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 SUS1YBR111W-A 291 nt1.62□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 PRP6YBR055C 2700 nt1.62□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 YPR089WYPR089W 2667 nt1.62□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 FIG2YCR089W 4830 nt1.61□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 SNF12YNR023W 1701 nt1.61□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 YDR199WYDR199W 366 nt1.61□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 SDC1YDR469W 528 nt1.61□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 LOC1YFR001W 615 nt1.61□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 YAL066WYAL066W 309 nt1.61□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 HRI1YLR301W 735 nt1.61□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 TMA10YLR327C 261 nt1.61□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 SWM2YNR004W 441 nt1.61□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 YBR277CYBR277C 402 nt1.61□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 CFT2YLR115W 2580 nt1.61□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 HSH155YMR288W 2916 nt1.61□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 SSQ1YLR369W 1974 nt1.6□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 RSM28YDR494W 1086 nt1.6□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 YIL058WYIL058W 285 nt1.6□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 YLR217WYLR217W 324 nt1.6□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 GIM5YML094W 492 nt1.6□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt1.6□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 YBR197CYBR197C 654 nt1.6□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 VPS16YPL045W 2397 nt1.6□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 BAS1YKR099W 2436 nt1.6□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 GAL80YML051W 1308 nt1.6□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 HER1YOR227W 3741 nt1.6□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 YDL163WYDL163W 303 nt1.59□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 CAP1YKL007W 807 nt1.59□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 SRL4YPL033C 846 nt1.59□□□□□ -2.15
NEJ1Q06148 PSO2YMR137C 1986 nt1.59□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 YDR250CYDR250C 276 nt1.58□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 RPS26BYER131W 360 nt1.58□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 YGL165CYGL165C 579 nt1.58□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt1.58□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt1.58□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 YET1YKL065C 621 nt1.58□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 YOL150CYOL150C 312 nt1.58□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 PKH3YDR466W 2697 nt1.58□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 SSF2YDR312W 1362 nt1.58□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 PES4YFR023W 1836 nt1.57□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 CDC37YDR168W 1521 nt1.57□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 RRP6YOR001W 2202 nt1.57□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 YCR099CYCR099C 468 nt1.57□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 YLR366WYLR366W 306 nt1.57□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 YLR379WYLR379W 375 nt1.57□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 YMR144WYMR144W 1029 nt1.57□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 YOR169CYOR169C 465 nt1.57□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 RBL2YOR265W 321 nt1.57□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 SAR1YPL218W 573 nt1.57□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt1.57□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 YNL034WYNL034W 1839 nt1.56□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 RUD3YOR216C 1455 nt1.56□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 HSL1YKL101W 4557 nt1.56□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 VPS35YJL154C 2835 nt1.56□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 PRK1YIL095W 2433 nt1.56□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 ASG1YIL130W 2895 nt1.56□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 YGR242WYGR242W 309 nt1.56□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 PRS3YHL011C 963 nt1.56□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 LIN1YHR156C 1023 nt1.56□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 VPS63YLR261C 327 nt1.56□□□□□ -2.16
NEJ1Q06148 BRX1YOL077C 876 nt1.56□□□□□ -2.16
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