Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
GRIN1Q05586 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN1Q05586 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms