Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR4Q05215 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms