Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GBE1Q04446 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms