Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUCB1Q02818 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUCB1Q02818 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms