Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PLOD1Q02809 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms