Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
DSG1Q02413 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSG1Q02413 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms