Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CENPEQ02224 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms