Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAP1Q01518 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAP1Q01518 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAP1Q01518 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAP1Q01518 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAP1Q01518 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAP1Q01518 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAP1Q01518 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAP1Q01518 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CAP1Q01518 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAP1Q01518 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAP1Q01518 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAP1Q01518 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAP1Q01518 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAP1Q01518 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAP1Q01518 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAP1Q01518 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms