Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms