Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms