Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CDK3Q00526 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK3Q00526 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms