Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms